Mary Elle Fanning 1998. április 9-én született a Georgia állambeli Conyers városban, az USA-ban. Édesanyja Joy (Arrington) Fanning egykori profi teniszezõnõ, édesapja pedig Steve Fanning, aki egy másodosztálybeli baseball csapatban, a St. Louis Cardinals-ban játszott. Jelenleg egy Los Angeles-i elektronikai üzletben eladó. Elle nővére, a ma már világsztár gyerekszínész, Dakota Fanning. 2001-ben, háromévesen szerepelt először filmben. A Nevem Samben szintén szereplő nővére által eljátszott Lucy Diamond Dawson kétéves kori alteregóját alakította, majd a Harmadik típusú emberrablásoknak 2002-ben bemutatott részében, (Charlie and Lisa) szintén az egyik szereplő gyerekkori megtestesítőjeként volt látható. A következő évben, 2003-ban a korábbiakhoz képest változást jelentett az Amy-nek ítélve és az Oviapu szerepe, bár utóbbiban, csak mellékszereplőként tűnt fel. Még ebben az évben a Miami helyszínelők, majd 2004-ben a New York-i helyszínelők egy-egy részében jelent meg. A két sorozat között pedig az A titkos ajtó című filmben. 2005-ben, egy rövidfilmet leszámítva, csak a Lelkipásztor-kutya vígjátékban dolgozott. Egy év múlva az ekkora már elismertté vált Doktor House egyik részében mutatkozott meg. A 2006-os évben, a Doktor House mellett, több filmben játszott: Sajttársak, Déja vu, Különleges ügyosztály, Az elveszett szoba. Az évben a legjelentősebb szerepe, Babelben volt, ahol Brad Pitt és Cate Blanchett lányát játszotta.

Voir plus